Το Αυστριακό Αρχαιολογικό Ινστιτούτο, το τελευταίο από τα ομοειδή ιδρύματα που εγκαινιάζονται τον 19ο αιώνα στην Ελλάδα, στεγάστηκε στο τριώροφο κτίριο που σχεδίασε ο Ερνέστος Τσίλερ (Ernst Ziller).
Το παράρτημα του Αυστριακού Αρχαιολογικού Ινστιτούτου στην Αθήνα ιδρύθηκε το 1898, με στόχο την προώθηση αρχαιολογικών ερευνών στον ελλαδικό χώρο. Στεγάστηκε στο νεοκλασικό μέγαρο της λεωφόρου Αλεξάνδρας, που οικοδομήθηκε μεταξύ των ετών 1905-1908.
Εφαρμόζοντας μια αναθεωρημένη μορφή της αρχικής του σύλληψης, ο Τσίλερ σχεδίασε ένα λιτό κτίριο, σε οικόπεδο που παραχωρήθηκε από το κράτος σε μια περιοχή σχεδόν ακατοίκητη.
Το Μέγαρο διακρίνεται για τα νεοκλασικά του στοιχεία, όπως η τριμερής διάταξη, οι παραστάδες στα παράθυρα, καθώς και οι αετωματικές επιστέψεις τους.
Μετά την προσάρτηση της Αυστρίας από τη Γερμανία το 1938 (Anschluss), το Αυστριακό Ινστιτούτο μετατράπηκε σε παράρτημα του αντίστοιχου Γερμανικού μέχρι το φθινόπωρο του 1944. Με την φυγή των στρατευμάτων κατοχής από την Ελλάδα, διέκοψε τις εργασίες του και επαναλειτούργησε μετά από μια εικοσαετία. Από το 1947 έως το 2003, στο ίδιο κτίριο στεγάστηκε και η Αυστριακή Πρεσβεία.
Το Αυστριακό Αρχαιολογικό Ινστιτούτο στην Αθήνα συνεχίζει την δράση του σε συνεργασία με ελληνικούς φορείς αρχαιολογικής έρευνας, έχοντας μέχρι τώρα πραγματοποιήσει σημαντικές ανασκαφές, μεταξύ άλλων, στην Αιγείρα, τους Λουσούς, την Αίγινα και την Ήλιδα.