Am 6. Juni 1887 wurde der Grundstein für das erste moderne Chemische Institut des neuen griechischen Staates gelegt und 1889 wurde das Gebäude nach Plänen des Architekten Ernst Ziller fertig gestellt.
Es hat gerade einmal zwei Jahre gedauert, das Alte Chemische Institut zu bauen, aber 20 Jahre von der Beschlussfassung bis zur Grundsteinlegung. In dieser langen Planungsphase wurden die Entwürfe von Ziller von dem Architekten Edmund Zastrau geprüft und dann auch gebilligt. Zastrau war berühmt für seinen Entwurf des Chemisch-physiologischen Instituts von Berlin. Auch der mehrfach ausgezeichnete Chemiker August Wilhelm von Hofmann, der die ersten vorbildlichen Versuchslabore am Royal College of Chemistry in London sowie an der Universität von Berlin eingerichtet hatte, war am Entwurf des Chemischen Instituts von Athen beteiligt.
Wegbereiter für ein modernes Chemisches Institut an der Athener Universität war Professor Anastasios Christomanos, der dann auch die Errichtung des Gebäudes beaufsichtigte. Es bestand dringender Bedarf an geeignetem Laborraum, denn die ersten Chemieprofessoren wie der Bayer Xavier Landerer, Alexandros Venizelos und auch Christomanos selbst führten bis dato ihre Versuche im Keller des Hauptgebäudes der Universität durch. Im Januar 1890 wurden dann die ersten Vorlesungen im neuen Gebäude gehalten und 1897 nahm im selben Gebäude auch die erste Universitätsweinkellerei ihren Betrieb auf sowie der erste Generator von Röntgenstrahlen.
Das Alte Chemische Institut, wie es inzwischen genannt wird zeichnet sich durch die strenge Schlichtheit seiner Fassaden aus. Einzige Dekoration ist der [neoklassizistische Giebel über den beiden ionischen Säulen am Eingang. Im Gebäudeinneren erhellen zwei Lichthöfe das große Auditorium und die Labore waren für die damalige Zeit bahnbrechend.
1911 wurde das Gebäude durch einen Brand stark beschädigt und erst 1918 wieder aufgebaut. Seine heutige Gestalt erhielt der Bau dann durch den dritten Stock, der für die Physik-, Pharmazie- und Pflanzenkundelabore aufgesetzt wurde. Zeitweise waren hier auch das Allgemeine Staatliche Chemische Institut, das Nationale Büro für Maß und Gewicht, die Gesellschaft für Meereswissenschaft, das Botanische Museum und die Griechische Astronautische Gesellschaft untergebracht.
Zum 100. Jahrestag seines Bestehens wurden die Labore des Chemischen Instituts 1989 auf den modernen Campus in Zografou verlegt. Heute befindet sich das Universitätsmuseum für Naturwissenschaften und Technologie in dem Gebäude, nachdem es zu Beginn des 21. Jahrhunderts grundlegend renoviert werden musste.
